۱. الشرح و التعلیقة علی توحید المفضل • کتاب الفکر المعروف بـ توحید المفضل، دلیل ما، چاپ اول، قم، ۱۳۸۵ش.، محقق: استاد شیخ قیس بهجت العطار

۲. التعلیقة علی الاهلیلجة فی التوحید • الاهلیلجة، دلیل ما، چاپ اول، قم، ۱۳۸۴ش.، محقق: استاد شیخ قیس بهجت العطار

۳. رسالة فی حل حدیث مذکور فی العلل و العیون • الاعتقادات و رسالة فی حل حدیث مذکور فی العلل و العیون، کتابخانه علامه مجلسی، قم، ۱۴۰۹ق.، محقق: مهدی رجائی

۴. رجعت • رسالت قلم، چاپ دوم، -۸۱۸ ۶ش.، مصحح: ابوذر بیدار

۵. تاریخ قتل عمربن الخطاب

۶. مشکوة الانوار • حسینیه عمادزاده اصفهان، اصفهان، ۱۴۱۲ق.، مصحح: دکتر عبدالحسین طالعی

۷. مفاتح الغیب به ضمیمه آداب نماز شب • آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، چاپ دوم، مشهد، ۱۳۶۹ش.، محقق: مهدی رجائی • آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، ۱۳۶۷ش.، محقق: مهدی رجائی

۸. زاد المعاد • کتابفروشی اسلامیه، تهران، ۱۳۶۱ش.

۹. ملحقات صحیفه سجادیه به کوشش: جویا جهانبخش • اساطیر، تهران، ۱۳۸۷ش.

۱۰. حلیة المتقین در ‌آد‌اب‌ و سنن‌ و ‌اخلاق‌ ‌اسلامی‌ • لقمان، قم، ۱۳۶۵ش. • برادران علمی، تهران، ۱۳۴۳ش. • عصر جوان، قم، ۱۳۸۴ش.

۱۱. بحار الأنوار • دارالکتب الإسلامیة، تهران، ۱۳۸۴ق.، 110 جلد • وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی، چاپ اول، تهران، ۱۴۱۳ق.، 4 جلد، محقق: آیة الله شیخ محمدباقر محمودی • دار الرضا، بیروت، 3 جلد، محقق: عبدالزهرا علوی

۱۲. ملاذ الأخیار فی فهم تهذیب الأخبار[محمدبن‌ حسن‌ طوسی‌] به اهتمام: دکتر سید محمود مرعشی نجفی • کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، قم، ۱۴۰۷ق.، 16 جلد، محقق: مهدی رجائی، اشراف: سید احمد حسینی اشکوری

۱۳. سه رساله درباره حجة بن الحسن العسکری • کانون پژوهش، چاپ اول، اصفهان، ۱۵ رمضان ۱۴۱۵ق.، محقق: مهدی رجائی، با مقدمه: محمود بحرالعلوم میردامادی

۱۴. الفریدة فی لوعة الشهیدة علیها السلام من موسوعة بحار الأنوار • دلیل ما، چاپ اول، قم، ۱۴۲۶ق.، محقق: عبدالزهرا علوی، با مقدمه: عبدالزهرا علوی

۱۵. اجوبة المسائل الهندیة • دارالکتاب الاسلامی، چاپ اول، قم، ۱۴۱۱ق.، محقق: مهدی رجائی

۱۶. الاعتقادات • الاعتقادات و رسالة فی حل حدیث مذکور فی العلل و العیون، کتابخانه علامه مجلسی، قم، ۱۴۰۹ق.، محقق: مهدی رجائی

۱۷. بیست و پنج رساله فارسی اعتقادی،فقه،حدیث... • کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، چاپ اول، قم، ۱۴۱۲ق.، اشراف: دکتر سید محمود مرعشی نجفی، مصحح: مهدی رجائی

۱۸. تحفة الزائر

۱۹. شرح دعاء الصباح (تألیف و تعلیق) • دعاء الصباح، دار العلوم، چاپ اول، بیروت، 1989م.

۲۰. جلاء العیون، تاریخ چهارده معصوم • سرور، قم، ۱۳۸۴ش.، محقق: علی امامیان

۲۱. حیوة القلوب • سرور، قم، ۱۳۸۴ش.، 5 جلد، محقق: علی امامیان

۲۲. شرح تائیه دعبل خزاعی • محدث، تهران، ۱۳۵۹ش.، مصحح: علی محدث

۲۳. الفرائد الطریفة فی شرح الصحیفة الشریفة • کتابخانه علامه مجلسی، اصفهان، ۱۴۰۷ق.، محقق: مهدی رجائی

۲۴. الهی نامه به کوشش: جعفر نبوی • میراث اسلامی ایران، کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، چاپ اول، قم، ۱۳۷۳ش.، 10 جلد

۲۵. مصیبت نامه • میراث اسلامی ایران، کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، چاپ اول، قم، ۱۳۷۳ش.، 10 جلد

۲۶. وجیزة الرجال

۲۷. رساله تحقیق مسأله بداء • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۲۸. ترجمه چهارده حدیث راجع به امام عصر و علائم ظهور و رجعت • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۲۹. رساله بهشت و دوزخ • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۳۰. رساله جبر و تفویض • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۳۱. رساله حکمت و فلسفه شهادت امام حسین علیه السلام • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۳۲. رساله دفع شبهه حدیث جهل و معرفت • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۳۳. رساله فرق میان صفات فعل و ذات • مجموعه رسائل اعتقادی، آستان قدس رضوی، بنیاد پژوهشهای اسلامی، مشهد، ۱۳۶۸ش.، محقق: مهدی رجائی

۳۴. رسالة الأوزان والمقادیر • سازمان اوقاف و امور خیریه،انتشارات اسوه، چاپ اول، تهران، ۱۳۸۸ش.، مصحح: محمدباقر ملکیان

۳۵. ترجمه فرحة الغری • مرکز پژوهشی میراث مکتوب، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۹ش.، مصحح: جویا جهانبخش

۳۶. کتاب توحید مفضل • کتابخانه صدر، تهران، ۱۳۵۹ش.، با مقدمه: علامه محمد تقی شوشتری

۱. علامه مجلسی بزرگمرد علم و دین نویسنده: استاد علی دوانی • امیرکبیر، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۰ش.

۲. تلامذة العلامة المجلسی والمجازون منه نویسنده: سید احمد حسینی اشکوری • کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، چاپ اول، قم، ۱۴۱۰ق.، اشراف: دکتر سید محمود مرعشی نجفی

۳. فیض قدسی زندگینامه علامه محمد باقر مجلسی مترجم: جعفر نبوی • شرکت انتشارات علمی و فرهنگی، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۴ش.

۴. نظم اللئالی معروف بسوال و جواب گردآورنده: محمد بن احمد حسینی لاهیجانی • دارالکتاب الاسلامی، چاپ اول، قم، ۱۴۱۱ق.، محقق: مهدی رجائی

۵. إجازات الحدیث التی کتبها شیخ المحدثین ومحیی معالم الدین المولی محمد باقر المجلسی الإصبهانی گردآورنده: سید احمد حسینی اشکوری • اجازات الحدیث، کتابخانه، موزه و مرکز اسناد مجلس شورای اسلامی، چاپ اول، تهران، ۱۳۹۰ش. • اجازات الحدیث، کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، چاپ اول، قم، ۱۴۱۰ق.، اشراف: دکتر سید محمود مرعشی نجفی

۶. إجازة مطولة من المجلسی الأول للثانی تسرد اکثر من أربعین طریقا إلی الشیخ الطوسی نویسنده: محمد واعظ زاده خراسانی • دانشگاه مشهد، دانشکده الهیات و معارف اسلامی، مرکز تحقیقات و مطالعات، مشهد، با مقدمه: محمد واعظ زاده خراسانی

۷. زندگینامه علامه مجلسی تاریخ علمی و اجتماعی اصفهان در قرن 11 هجری نویسنده: سید مصلح الدین مهدوی • حسینیه عمادزاده اصفهان، اصفهان، 2 جلد

۸. کارنامه علامه مجلسی شرحی فشرده پیرامون خدمات و تألیفات علامه مجلسی و تراوش وجودی او در حفظ آثار شیعه نویسنده: عطائی خراسانی • کتابفروشی اسلامیه، مشهد

۹. مبانی متن محورانه علامه مجلسی در انتخاب مصادر و احادیث بحار الأنوار با تأکید بر احادیث ناظر بر امامت نویسنده: محسن قاسم پور، ابوطالب مختاری‌هاشم‌آباد

۱۰. مبانی اعتبار سنجی روایات بحارالانوار نزد علامه مجلسی نویسنده: محسن قاسم پور، ابوطالب مختاری‌هاشم‌آباد